Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ecm2Q5FW85 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms