Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms