Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trim80Q3V061 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trim80Q3V061 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trim80Q3V061 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trim80Q3V061 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim80Q3V061 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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