Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms