Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms