Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Znf48Q3US17 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf48Q3US17 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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