Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms