Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms