Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf166Q3U9F6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf166Q3U9F6 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf166Q3U9F6 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf166Q3U9F6 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms