Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tmem35bQ3U0Y2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms