Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms