Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms