Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc102aQ3TMW1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms