Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms