Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms