Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms