Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms