Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms