Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q149G0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q149G0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q149G0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q149G0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q149G0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q149G0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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