Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd2Q149F1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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