Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Spatc1Q148B6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Spatc1Q148B6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Spatc1Q148B6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Spatc1Q148B6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Spatc1Q148B6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Spatc1Q148B6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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