Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms