Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms