Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrioQ0KL02 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms