Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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Ttc21bQ0HA38 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Ttc21bQ0HA38 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Ttc21bQ0HA38 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Ttc21bQ0HA38 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Ttc21bQ0HA38 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms