Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms