Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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