Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Kcnma1Q08460 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms