Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sh3bp2Q06649 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sh3bp2Q06649 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sh3bp2Q06649 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sh3bp2Q06649 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sh3bp2Q06649 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sh3bp2Q06649 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sh3bp2Q06649 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms