Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms