Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms