Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms