Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms