Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms