Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23aQ01405 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms