Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgcrQ01237 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms