Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms