Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelpQ01102 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelpQ01102 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms