Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grin2cQ01098 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Grin2cQ01098 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms