Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms