Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms