Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms