Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms