Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms