Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms