Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mesp1P97309 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms