Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irx2P81066 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms