Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms