Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgf11P70378 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms