Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux2P70298 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms